כחלק מתפקידו כמנהל המערך לקרדיולוגיה במחוז תל אביב-יפו, ד״ר יעקבישוילי מנהל את מכון הלב במרכז החדש לרפואה יועצת בחולון. בנוסף לטיפול בחולים עם מגוון רחב של בעיות לב וכלי דם (אי ספיקת לב, הפרעות קצב, שיקום אחרי התקף לב וניתוחי מעקפים, מחלות כלי דם היקפית), ד״ר יעקבישוילי הקים שירות אקו-לב במאמץ, לראשונה במחוז.

בשנת 2013, בעת ששימש כקרדיולוג בכיר במערך הלב במרכז הרפואי רבין, ד״ר יעקבישוילי ייסד את השירות הקרדיו-אונקולוגי הראשון בישראל. השירות מטפל בחולים עם סרטן פעיל שסובלים ממחלות לב או ממחלימים אשר קיבלו טיפול שמשפיע על מצב הלב וכלי הדם - גם שנים רבות אחרי הטיפול בסרטן. פעילות זו, ששיפרה משמעותית את איכות הטיפול והחיים של המטופלים, נמשכת ביתר שאת ברפואה הקהילתית, בייחוד למטופלים שהחלימו ממחלות ממאירות.
בשנת 2018, ד״ר יעקבישוילי ריכז את הועדה לקביעת נהלים למעקב קרדיו-וסקולרי אחרי חולים אונקולוגיים בבתי חולים ובקהילה מטעם המועצה הלאומית למניעה וטיפול במחלות לב וכלי דם של משרד הבריאות.

מתוקף הובלתו בתחום הקרדיו-אונקולוגי בעולם, ד״ר יעקבישוילי מתפקד כחבר בצוות העורכים בכתב העת המדעי בתחום מבית כתב העת המדעי המוביל בקרדיולוגיה, JACC/Cardio-Oncology ומשמש כיועץ בינלאומי בכיר לעיתון זה. כמו כן, ד״ר יעקבישוילי חבר בצוות העורכים בכתב העת המדעי הרשמי של האיגוד הקרדיו-אונקולוגי הבינלאומי (ICOS), Cardio-Oncology.

בשנת 2019, נבחר ד״ר יעקבישוילי לשמש כמזכיר החוג לקרדיולוגיה בקהילה באיגוד הקרדיולוגי בישראל. מתוקף תפקידו, ד״ר יעקבישוילי מארגן מפגשים מדעיים, מוביל קבוצות בגיבוש מדיניות בטיפול במחלות לב בקהילה ויצירת רצף טיפולי מיטיב עם החולים בשיתוף בתי החולים.

בשנת 2020, ד״ר יעקבישוילי ריכז את הועדה להקמת מרכזי אי ספיקת לב בקהילה מטעם המועצה הלאומית למניעה וטיפול במחלות לב וכלי דם של משרד הבריאות.

ד״ר יעקבישוילי מנהל את המערך לקרדיולוגיה משנת 2018, ומוביל את שלושת מכוני הלב שבמחוז למצוינות ולסטנדרטים הגבוהים ביותר בטיפול ויחס למטופלים. כחלק מתפקידו, ד״ר יעקבישוילי מוביל לשיתופי פעולה עם דיסציפלינות שונות, ביניהם רופאי סוכרת, כלי דם ומשפחה, מארגן מפגשים מדעיים, ויוזם ומוביל עבודות מחקר בקרדיולוגיה במחוז.

בשנת 2019, הצטרף ד״ר יעקבישוילי למערך לקרדיולוגיה בבית החולים החדש באשדוד, בו הוא משמש כקרדיולוג בכיר ועמית מחקר במכון המחקר במערך.

בשנת 2015, בהובלת ד״ר יעקבישוילי, התקיים הכנס הבינלאומי המקצועי הראשון בקרדיו-אונקולוגיה. הכנס, בהנחייתו והובלתו, מושך חוקרים ורופאים המובילים למפגש רב-תחומי זה, אשר מתקיים אחת לשנתיים. ד״ר יעקבישוילי מוזמן כמרצה-אורח בכיר לכנסים ברחבי העולם בתחום חדשני זה.

החל משנת 2018, ד״ר יעקבישוילי מכהן כחבר בקבוצת העבודה לקרדיו-אונקולוגיה בחברה לאי ספיקת לב האירופאית (HFA-ESC) ונוטל חלק פעיל בחיבור הקווים המנחים באבחון וטיפול בחולים קרדיו-אונקולוגיים. קבוצה זו נחשבת לאחת הקבוצות המשפיעות ביותר בתחום בעולם.

כחלק מהמערך הקרדיולוגי, מרכז רפואי רבין, בילינסון, ד״ר יעקבישוילי הוביל את הקליטה והטיפול בחולים הנמצאים בסכנת חיים כתוצאה מאוטם חד בשריר הלב, הפרעות קצב קשות, אי ספיקת לב חריפה, הפרעה קשה בתפקוד מסתמי הלב, הצטברות נוזל פריקרדיאלי ועוד.

בין השנים 2015-2019, ד״ר יעקבישוילי כיהן כיו״ר החוג המקצועי הגדול ביותר באיגוד הקרדיולוגי. החוג מאחד את כל היחידות לטיפול נמרץ לב וביניים הפועלות בישראל ואחראי על קיום מפגשים מדעיים, עריכת הסקר הדו-שנתי ACSIS, כתיבת ניירות עמדה מקצועיים ועוד. לפני כן, בין השנים 2011-2015, כיהן ד״ר יעקבישוילי כמזכיר החוג.

פעילותו הענפה באיגוד תרמה לביסוס והעמקת הידע המקצועי בקרב כלל הקרדיולוגים בישראל העוסקים בתחום, כמו גם הקשרים עם האיגודים המובילים בעולם בקרדיולוגיה.